En la transesterificación los triglicéridos deben tener una baja proporción de ácidos grasos libres para evitar que se neutralicen con el catalizador y se formen también jabones. Para tener esa proporción baja de ácidos grasos libres en la reacción de transesterificación se da una reacción secundaria que es la, reacción de neutralización, cuya función es eliminar dichos ácidos grasos libres presentes en el aceite y así poder evitar la producción de jabón.
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